Das seit 1954 als Segelflugplatz genutze Areal in der Nähe von Greven wird 1968 von der Flughafen Münster/Osnabrück GmbH übernommen.
1972 wird der Flughafen mit seiner 2000m langen Start- und Landebahn offiziell eröffnet. Die erste Airline vor Ort war Cimber Air, später wurden auch Charterflüge für verschiedene Reiseveranstalter durchgeführt.
Bis 1976 finden weitere Ausbaumaßnahmen statt, so werden ein Instrumentenlandesystem, sowie ein Tower gebaut und die Bahn um 170m verlängert.
1987 wird eine zusätzliche Flugzeughalle fertiggestellt, ein Jahr später erkennt man das Frachtgeschäft in FMO als einen Geschäftszweig, wozu in den folgenden Jahren eine eigene Cargohalle gebaut wird.
Seit 1990 prägt das Bild des Flughafens ein neuer Tower, die Arbeiten an einem neuen Terminal laufen auf Hochtouren - 1995 kann es schließlich eröffnet werden.
Bereits einige Jahre später reichten die Kapazitäten des vorhandenen Terminals nicht mehr aus, und der Bau des neuen Terminal 2 wird in Angriff genommen - 2001 wird es eingeweiht.
Im Jahre 2003 wird die Wartungshalle der Air Berlin fertiggestellt, in der Flugzeuge vom Typ Boeing 737 gewartet werden können. Air Berlin ist in Münster/Osnabrück stark vertreten.
2005 werden wieder Pläne für die Zukunft geschmiedet, so wurde eine Startbahnverlängerung auf mindestens 3000m genehmigt